Santa Margarita atau lebih dikenali sebagai Perbandaran Santa Margarita merupakan sebuah perbandaran di wilayah Samar, Filipina. Perbandaran ini mempunyai jumlah penduduk seramai 27,012 dalam isi rumah 6,348. Ia mempunyai luas 129.12 kilometer persegi dan ketinggian 29 meter di atas permukaan laut. Ia diberikan dengan kod kawasan telefon +63 (0)55 dan poskod 6718.